細(xì)菌是生物的主要類群之一，也是所有生物中數(shù)量較多的一類，廣泛分布于土壤和水中，或與其他生物共生。據(jù)估計(jì)，人體內(nèi)及表皮上的細(xì)菌細(xì)胞總數(shù)約是人體細(xì)胞總數(shù)的十倍，與人類生活息息相關(guān)，影響著人類健康。因此明確細(xì)菌基因序列是深入研究其表達(dá)調(diào)控、毒性、代謝等生物功能的基礎(chǔ)。
美國太平洋生物科學(xué)公司（PacBio）推出的Single Molecule Real-Time sequencing（SMRT），即單分子實(shí)時(shí)測序，實(shí)現(xiàn)了對單個(gè)DNA分子的實(shí)時(shí)監(jiān)控測序。其具有長讀長、無GC偏向和無PCR擴(kuò)增等優(yōu)勢，有效解決了傳統(tǒng)二代測序技術(shù)的組裝難題，大幅度提升了基因組組裝的指標(biāo)，能夠克服細(xì)菌基因組GC異常、高度重復(fù)的問題，得到細(xì)菌完成圖，No Gap，No N堿基。
我們的優(yōu)勢
豐富的建庫、上機(jī)經(jīng)驗(yàn)
豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)
周期短，有競爭力的價(jià)格優(yōu)勢
高質(zhì)量的數(shù)據(jù)保障
技術(shù)流程
數(shù)據(jù)分析
我們的生物信息團(tuán)隊(duì)提供基因組的組裝，優(yōu)化以及完整的基因注釋
樣本要求
| 樣本類型 | 總量 | 濃度 | OD260/OD280 |
| 基因組DNA | ≥5 μg | ≥50 ng/μl | ≥ 1.8 |
技術(shù)參數(shù)
| 測序平臺(tái) | 文庫類型 | 測序深度 | 組裝指標(biāo) |
| PacBio SMRT | 20 K | ≥ 60X | 完成圖 （1-2 contig，無N堿基） 單堿基錯(cuò)誤率＜0.01% |