染色質免疫共沉淀測序(Chromatin Immunoprecipitation Sequencing,ChIP-Seq)是指將深度測序技術與ChIP實驗相結合分析全基因組范圍內DNA結合蛋白結合位點、組蛋白修飾、特定轉錄因子的基因調控作用、核小體定位或DNA甲基化的高通量方法。隨著新一代測序技術的發展和成熟,使得這項技術可應用到各種基因組序列已知的物種,并能確切得到片段的序列信息,從而在全基因組范圍對蛋白結合位點進行高效而準確的篩選與鑒定。
安必奇生物信息團隊的ChIP-Seq技術服務具有成本低、效率高、檢測靈敏度高和覆蓋度高等優勢,通過多年的發展以及多個項目經驗的積累,以期為您的染色質免疫共沉淀測序項目提供完整的解決方案。
我們的優勢
性價比高:實驗周期短、分析信息全,針對感興趣的區域及相關基因,用于大樣本量及高深度研究
高靈敏度:實驗對起始DNA量的要求很低,從而使得起始細胞數目的減少,更有利于早期胚胎發育相關的研究
靈活性強:可以應用到各種基因組序列已知的物種,并能確切得到每一個片段的序列信息
高分辨率:強大的生物信息計算能力,可以高效地將測序得到的序列定位到特定基因組的精確堿基位置上,分辨率高
定制化的染色質免疫共沉淀測序方案:可根據實際需求制定個性化的染色質免疫共沉淀測序方案
技術流程
采用特異性抗體對目的蛋白進行免疫沉淀后,分離與其結合的基因組DNA片段,再通過高通量測序與數據分析,在全基因組范圍內尋找目的蛋白的DNA結合位點,并且可以基于多個樣品進行差異比較。

數據分析

應用領域
表觀異質性
環境與表觀遺傳
基因表達調控
疾病研究
染色質重塑
遺傳印記
樣本要求
| 樣本類型 | 總量 | 濃度 | OD260/OD280 |
| DNA | ≥10ng | ≥1ng/μl | 1.8-2.0 |
技術參數
| 測序平臺 | 測序策略 | 數據量 | 運轉周期 |
| HiSeq | SE 50 | 20M或40M clean reads | 根據具體項目情況而定 |
詢價及訂購
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參考文獻
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Hewitt S C, Li L, Grimm S A, et al. Research resource: whole-genome estrogen receptor α binding in mouse uterine tissue revealed by ChIP-seq [J]. Molecular endocrinology, 2012, 26(5): 887-898.
Park P J. ChIP–seq: advantages and challenges of a maturing technology [J]. Nature Reviews Genetics, 2009, 10(10): 669-680.





