環狀RNA(circular RNA,circRNA)呈封閉環狀結構,是近期研究的熱點,它大量存在于真核細胞胞質內,主要由pre-mRNA通過可變剪切加工產生,不受RNA外切酶影響,表達更穩定,不易降解。
近年的研究表明,circRNA具有重要的調控功能,例如circRNA可發揮競爭性內源RNA(ceRNA)機制,由于其分子富含microRNA(miRNA)結合位點,在細胞中起到miRNA海綿的作用,進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達水平。特別是通過與疾病關聯的miRNA相互作用,研究證明circRNA能影響癌癥細胞的增殖、浸潤與轉移、血管生成以及細胞凋亡。除此以外,circRNA也具有調控其他類型RNA、調節蛋白質活性等功能。
這些特性使得circRNA具有開發疾病新型診斷與治療方法的潛力,研究意義重大。circRNA測序的主要應用領域有腫瘤等疾病致病機理研究;生長發育過程中的基因表達調控變化;其他關心基因轉錄表達調控的研究方向等。
我們的優勢
一站式服務,從樣本接收到數據分析
多物種適用,可檢測人、動植物的circRNA
高覆蓋度,可檢測低豐度的circRNA
穩定高效的項目流程
周期短,有競爭力的價格優勢
技術流程

數據分析
標準分析
原始數據質控
比對到參考基因組
circRNA鑒定與統計:統計reads類型、circRNA類型與分布
來源基因富集分析
circRNA注釋
表達量計算與樣品間表達差異分析
差異基因GO分析;KEGG分析
生物學重復樣品間相關性分析
circRNA序列預測
高級分析
circRNA保守性分析
circRNA、miRNA、mRNA互作分析
技術參數
| 樣本要求 | 測序策略 |
| 樣本類型:Total RNA 總量:10 μg/單次建庫 | 文庫類型:300 bp 測序平臺:Illumina 150PE 測序深度:8 G/樣 |
樣本要求
| 樣本類型 | 總量 | 濃度 | RIN值 |
| Total RNA | 10 μg | ≥200 ng/μl | ≥7.5 |
技術參數
| 測序平臺 | 文庫類型 | 測序深度 |
| Illumina 150PE/250PE | 300 bp | 8 G |





