真菌，是真核生物中的一大類群，包括酵母、霉菌等微生物，以及人們熟知的菇類。真菌遍及全世界，在地球生物圈中有著與眾不同的進化和生活方式，伴隨著人類生活，與人類健康息息相關，有著重要的經濟和醫(yī)學價值。世界上首例抗生素——青霉素就來源于霉菌。真菌的基因組大小約為2.5 M~150 M，復雜程度僅次于動植物，獲得真菌全基因組序列，并對其進行結構和功能研究，可以讓我們更好的對這些菌株深入研究，更好的了解和利用真菌資源，為人類社會創(chuàng)造更大的價值。
隨著測序技術的發(fā)展，越來越多的真菌基因組被發(fā)表，但大多數(shù)基因組都是不完整的，缺乏連續(xù)的長片段。現(xiàn)在利用PacBio平臺可以很好的解決這個難題，其長讀長可以輕松跨越GC含量異常和高重復序列，實現(xiàn)reads覆蓋的完整性和均一性，幫您得到更完整的真菌基因組序列。我們可以提供真菌Survey、真菌框架圖、真菌精細圖三種不同精細程度的真菌基因組測序方案，滿足不同的科研需求。
我們的優(yōu)勢
豐富的項目經驗
高質量的數(shù)據(jù)保障
周期短，有競爭力的價格優(yōu)勢
專業(yè)的生物信息分析團隊
技術流程
數(shù)據(jù)分析
我們的生物信息團隊提供基因組的組裝，優(yōu)化以及完整的基因注釋
樣本要求
| 樣本類型 | 總量 | 濃度 | OD260/OD280 |
| 基因組DNA | ≥10 μg | ≥50 ng/μl | ≥ 1.8 |
技術參數(shù)
| 產品類型 | 測序平臺 | 文庫類型 | 測序深度 | 組裝指標 |
| 真菌Survey | Illumina PE150 | 350 bp | ≥100X | 無 |
| 真菌框架圖 | Illumina PE150 | 350 bp | ≥100X | 無 |
| 真菌精細圖 | PacBio SMRT | 20 K | ≥ 60X | Contig N50>2 Mb 單堿基錯誤率：<0.01% 基因組覆蓋度：>98% 基因區(qū)覆蓋度：>99% |