RNA Immunoprecipitation (RIP) 是研究細(xì)胞內(nèi)RNA與蛋白結(jié)合情況的技術(shù)，是了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)動態(tài)過程的有力工具，能幫助我們發(fā)現(xiàn)miRNA的調(diào)節(jié)靶點(diǎn)。這種技術(shù)運(yùn)用針對目標(biāo)蛋白的抗體把相應(yīng)的RNA-蛋白復(fù)合物沉淀下來，然后經(jīng)過分離純化就可以對結(jié)合在復(fù)合物上的RNA進(jìn)行測序分析。
安必奇的生物信息團(tuán)隊為您提供一站式的RIP-Seq技術(shù)服務(wù)，從材料選取，建庫測序到數(shù)據(jù)分析，每一步都經(jīng)過科學(xué)縝密的設(shè)計，為您深度解析目標(biāo)RNA種類以及其與蛋白的相互作用，保障高質(zhì)量的研究成果。
我們的優(yōu)勢
性價比高：實驗周期短、分析信息全，價格低
高覆蓋度：全轉(zhuǎn)錄組的覆蓋，可在全轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi)對蛋白結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行篩選和鑒定
高靈敏度：每個樣本可獲得數(shù)百萬條的序列標(biāo)簽，可發(fā)現(xiàn)研究轉(zhuǎn)錄組上稀有的蛋白結(jié)合位點(diǎn)
高精確率：可獲得高水平的信噪比數(shù)據(jù)，準(zhǔn)確區(qū)分真實事件與噪音，精確定位蛋白結(jié)合位點(diǎn)
定制化的RNA免疫共沉淀測序方案：可根據(jù)實際需求制定個性化的RNA免疫共沉淀測序方案
技術(shù)流程
采用特異性抗體對目的蛋白進(jìn)行免疫沉淀后，分離與其結(jié)合的RNA片段，再通過高通量測序與數(shù)據(jù)分析，在全轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi)篩選及鑒定目的蛋白的RNA結(jié)合位點(diǎn)，并且可以基于多個樣品進(jìn)行差異比較。
數(shù)據(jù)分析
樣本要求
| 樣本類型 | 總量 | 濃度 | OD260/OD280 |
| DNA | ≥50ng | ≥30ng/μl | 1.8-2.0 |
技術(shù)參數(shù)
| 測序平臺 | 測序策略 | 數(shù)據(jù)量 | 運(yùn)轉(zhuǎn)周期 |
| HiSeq | SE 50 | 20M clean reads | 根據(jù)具體項目情況而定 |
詢價及訂購
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參考文獻(xiàn)
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Kanematsu S, Tanimoto K, Suzuki Y, et al. Screening for possible miRNA–mRNA associations in a colon cancer cell line [J]. Gene, 2014, 533(2): 520-531.