在單克隆抗體的生產過程中，由于效應B淋巴細胞的特異性是不同的，經選擇培養基首次篩選出來的雜交瘤細胞產生的抗體存在差異，須對雜交瘤細胞進行第二次篩選，選出能產生特異性性抗體的雜交瘤細胞。
篩選方法要求快速、靈敏、可靠而且利于一次性處理大量樣品，因為數百個樣品需要在短短幾小時就得出檢測結果，以便決定雜交瘤細胞的取舍。篩選的第一步是無菌吸取每個培養孔的上清液，用多頭取樣器進行。單抗篩選檢測可供選擇的方法有：固相放射免疫測定（RIA），可用于可溶性抗原、細胞McAb的檢測；酶聯免疫吸附測定（ELISA），可用于可溶性抗原、細胞和病毒等McAb的檢測；免疫熒光試驗（IFA），適合于細胞表面抗原的McAb的檢測；其他如細胞毒實驗，空斑試驗，間接血凝試驗，旋轉粘附雙層吸附試驗（SADIST），免疫金試驗等。
現將常見且敏感的特異檢測法簡述如下：
1 RIA測定法
快速而完全的將反應后游離的，與抗體結合的抗原分離是進行放射免疫分析的必備條件。由于抗原—抗體復合物在低濃度時不能自行沉淀下來，因此常用物理，化學或者免疫學方法將其分開。在測定系統中，只有分離完全才能準確的分別測出游離的與結合抗原的放射性。
常用的有兩種方法：
（1）雙抗體法：即所謂的放射免疫沉淀法。此法是根據競爭性抑制原理，即標記抗原與待測的非標記抗原共同競爭一定量的相應抗體，待形成抗原—抗體復合物后，加入第二抗體進行沉淀，經離心洗滌以后，測定沉淀的脈沖數，如待測抗原批量多，則標記抗原的量變少，沉淀物的脈沖數也就低。
（2）固相法：將抗體包被于塑料管的內壁上，加入非標記的待測樣品，溫育，沖洗；再加入標記抗原，待測樣品中含有非標記抗原與管壁上抗體部位結合，可抑制后加入的抗原與抗體的結合，保溫后，將游離的抗原洗去，即可測定塑料管中的抗原—抗體復合物的放射性。該法可省去離心沉淀步驟，便于大批標本檢測。
2 酶聯免疫吸附測定——間接ELISA法
這是比較常見的檢測法，原理是將抗原抗體的特異反應與免疫檢測技術相結合。其可以間接檢測有無抗體和抗原及其量。在一定條件下，抗原能結合到固相載體表面，并保持其免疫活性。若待測樣品存在對此抗原特異性的抗體，就會結合載體表面的抗原。然后，與酶標記的第二抗體一起溫育，即可根據酶解產物顏色的深淺，判斷有無對應的抗體及其量的多少。
用于融合的骨髓瘤細胞由于是HPRT缺乏株，所以不能利用替代途徑合成核苷酸而在選擇培養基中死亡，而雜合細胞由于具有親本細胞的遺傳特性，可以在培養基中長期存活與繁殖。
3 親和素-生物素ELISA法
親和素與生物素有親和性。活化后的生物素可與蛋白質，核酸等大分子物質偶聯，可以被酶標記。一個蛋白質上可以連接多個生物素分子，形成多價生物素化抗體或者酶衍生物。一份子親和素又可以結合四個分子的生物素，因此即產生多級放大作用。當親和素與生物素酶作用時，很快形成親和素-生物素酶復合物。反應體系中再加入生物素化抗體時，復合物中尚未飽和的親和素結合部位即可以與偶聯于抗體上的生物素相結合，抗體則與抗原結合，通過酶顯色反應顯示抗原的特異性。此方法靈敏度高，非特異性著色少。
4 其他方法
斑點試驗測定法：本法是中國科學院上海細胞生物學研究所報道，對哺乳類如綿羊和鼠紅細胞等的抗原測定是個較好的方法，用來對抗北京鴨紅細胞單克隆抗體的試驗收到較好的效果。本法還可以擴大應用到可溶性抗原，如蛋白質和半抗原的測定。
空斑試驗及微球濾膜復制法：本法用來測定培養在軟瓊脂平板上的雜交瘤細胞，如抗原為紅細胞，半抗原或蛋白質等。
免疫熒光法：免疫球蛋白試劑可以和熒光素結合，用熒光顯微鏡進行篩選。這是為適應大量檢測需要而發展起來的一種檢測手段，效果比較好。
篩選過程中需要注意以下幾點：
1 雜交瘤細胞大多數不夠穩定，除了篩選方法及早確定外，一旦陽性細胞群落選出來，就應該盡早進行克隆化培養及冷凍保存，以免染色體丟失，抗體的輕重鏈分離或非特異性細胞在同一個培養孔內的過度生長而影響勻一性。
2 對于只有一個群落的陽性孔里的雜交瘤細胞，除可取出部分細胞用作克隆化培養外，其余均可直接轉入含有108小鼠腹腔巨噬細胞作為飼養細胞的小培養瓶，擴大培養，以便及時凍存。為了保險，也可以在原孔中留下少量細胞繼續培養。
3 在吸取上清液時，每個培養孔應單獨使用一支無菌的毛細管，且不要攪動培養孔中的細胞。進行檢測的培養孔至少3天內不應換液，否則上清液中抗體可被稀釋而影響其效價，甚至無法檢測出。對已經取出小量上清液的各培養孔，需及時補充新的完全培養基繼續培養。
4 所吸出的上清液當天就進行抗體檢測，若必須延長至次日測定，應將標本存放于4℃冰箱。
5 測試時，在不同間隔，每孔測2-3次，陽性孔保留，陰性孔放棄。
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